Es un cambio en el movimiento de las masas de aire sobre la tierra que retarda el flujo normal de las aguas marinas, lo que desencadena aguas en calientes en Sudamérica que resultan en lluvias y estragos para los pueblos de América del Sur, Indonesia y Australia.

El nombre de "El Niño" se debe a pescadores del puerto de Paita al norte de Perú que observaron que las aguas del sistema de Corrientes Peruana ó Corriente de Humboldt, que corre de sur a norte frente a las costas de Perú y Chile, se calentaban en la época de las fiestas navideñas y los cardúmenes o banco de peces huían hacia el sur, debido a una corriente caliente procedente del Golfo de Guayaquil (Ecuador). A este fenómeno le dieron el nombre de Corriente del Niño, por el Niño Jesús. Es un fenómeno con más de once milenios de historia climática.